In Bully: Scholarship Edition speel je de rol van de scholier Jimmy Hopkins. Jimmy is meerdere malen van verschillende scholen afgeschopt en krijgt op de school Bullworth eigenlijk zijn laatste kans. Op school wordt Jimmy lastig gevallen door pestkoppen, vervelende leraren en zal hij er als puber alles aan doen om een vriendinnetje te scoren. Jimmy kan vrij op Bullworth rondlopen en daar allemaal verschillende opdrachten doen. Deze opdrachten hebben vaak te maken met het helpen van andere schoolkinderen om zo wat populairder te worden.

Als je geen zin hebt om de normale missies te doen, kun je ook één van de vele minigames spelen. Jimmy kan bijvoorbeeld ook lessen volgen om nieuwe dingen te leren. Deze lessen vormen slechts enkele van de vele minigames die Bully rijk is. Op de kermis valt ook genoeg te doen, je kunt daar bijvoorbeeld ballen gooien op bewegende doelen en racen in karts.

Bully: Scholarship Edition is een herziene versie van de PS2-game Canis Canem Edit (in de Verenigde Staten bekend als Bully). Aan deze versie zijn onder andere acht nieuwe missies toegevoegd, vier nieuwe lessen (biologie, muziek, wiskunde en aardrijkskunde), nieuwe kleding en een aantal minigames voor twee spelers.