Naruto Shippuden: Kizuna Drive is een actiespel waarin spelers een origineel verhaal doorlopen met nieuwe personages. Ze vechten zich een weg door hordes aan vijanden in verschillende missies. Om de fans van de animatieserie een authentieke ervaring te bieden, bevat de game Japanse voice-overs, geanimeerde tussenfilmpjes en een openingsnummer dat is ingezongen door de stemacteur van Naruto.

Ook bevat de game een cooperatieve spelmodus voor vier spelers, waarin zij in tactische gevechten moeten samenwerken tegen vele vijanden en eindbazen, waaronder Skukau en Kyubi. Spelers kunnen zelf kiezen om te spelen met onder andere Naruto, Sakura, Kakashi en Shikamaru.