Super Monkey Ball Adventure is de eerste Super Monkey Ball-titel die zowel een avontuur met verhaallijn biedt als de klassieke puzzellevels. Aiai moet twee de conflicten tussen twee koninkrijken (Monkitropolis en Kongri-la) zien te sussen en daarvoor zal hij naar vijf verschillende Monkey werelden moeten reizen. De klassieke Super Monkey Ball gameplay is geintegreerd in het verhaal en daarbij krijg je een scala aan nieuwe bewegingen die je kunt uitvoeren.

Zoals elke game in deze serie kan je ook in Super Monkey Ball Adventure een aantal partygames spelen met zijn vieren. Naast een aantal klassieke beschikt de game ook over drie compleet nieuwe partygames.